Khi mới thành lập (1974–1975) do nhân sự còn ít, Ngành Ngư Nghiệp (tiền thân Khoa Thủy Sản – Trường Đại học Nông Lâm Tp.HCM chưa có các bộ môn độc lập. Năm 1976–1977 trên cơ sở nguồn cán bộ được tăng cường, Khoa Thủy Sản thành lập 3 bộ môn: Bộ môn Cơ sở, Bộ môn Kỹ thuật Nuôi cá và Bộ môn Khai thác-Chế biến TS. Năm 1995, Bộ môn Kỹ thuật Nuôi cá được tách thành 2 Bộ môn Kỹ thuật Nuôi trồng thủy sản nước ngọt và Bộ môn Kỹ thuật Nuôi trồng thủy sản ven biển. Từ năm 1998, 2 bộ môn trên được sát nhập thành Bộ môn Kỹ thuật Nuôi trồng thủy sản cho đến nay. Bộ môn Kỹ thuật Nuôi trồng thủy sản là một trong những bộ môn chủ lực của Khoa Thủy Sản (KTS) với nhiệm vụ giảng dạy và nghiên cứu khoa học kết hợp với các bộ môn khác trong khoa nhằm đào tạo đội ngũ kỹ sư thủy sản với các chuyên ngành như Nuôi trồng thủy sản, Ngư y (Bệnh học thủy sản), kinh tế thủy sản và chế biến thủy sản. Đặc biệt, Bộ môn Kỹ thuật Nuôi thủy sản với đội ngũ giảng viên và chuyên viên kỹ thuật có trình độ chuyên môn, kiến thức chuyên ngành và kinh nghiệm chuyên sâu trong lĩnh vực nuôi trồng thủy sản. Mục tiêu của Bộ môn là đào tạo đội ngũ kỹ sư thủy sản, đặc biệt đối với chuyên ngành Nuôi trồng thủy sản có trình độ chuyên môn và kỹ năng thực hành tốt, có thể đáp ứng được nhu cầu tuyển dụng và làm việc tốt trong bối cảnh phát triển bền vững và hội nhập quốc tế.
Các Trưởng Bộ môn qua các thời kỳ:
Về công tác giảng dạy, bộ môn Kỹ thuật nuôi có kế hoạch tuyển dụng thêm từ 2-3 giảng viên để thay thế các thầy cô đã nghỉ hưu. Bộ môn cùng với Khoa đã hoàn tất hồ sơ kiểm đinh đạt chuẩn AUN cho ngành ‘Nuôi trồng thủy sản’ trong năm 2022. Khung chương trình và chuẩn đầu ra của ngành ‘Nuôi trồng thủy sản’ cũng được xây dựng và chỉnh sửa cho phù hợp vời nhu cầu và đòi hỏi của các bên liên quan trong ngành thủy sản dựa trên nhiều ý kiến đóng góp được khảo sát. Sinh viên được học lý thuyết kết hợp với thực hành thực tế một cách đa dạng và phong phú. Định kỳ 2 năm một lần sẽ có những điều chỉnh lại khung chương trình sao cho luôn đáp ứng được nhu cầu và đòi hỏi của các bên liên quan và phát triển bền vững và hội nhập trong lĩnh vực chuyên ngành nuôi trồng thủy sản. Về nghiên cứu khoa học, Bộ môn kỹ thuật nuôi trồng thủy sản cùng với Khoa và các bộ môn khác thực hiện chiến lược chung của nhà trường nhằm đẩy mạnh công tác nghiên cứu khoa học để đạt mục tiêu trở thành trường đại học nghiên cứu chất lương quốc tế. Bộ môn kỹ thuật nuôi trồng thủy sản tập trung các nghiên cứu theo hướng nghiên cứu ứng dụng các thành tựu khoa học công nghệ vào thực tiển sản xuất đáp ứng mục tiêu phát triển bền vững và hội nhập trong lĩnh vực nuôi trồng thủy sản bao gồm.